يعتبر النظام الداخلي لجامعة المنارة المرجع الأساسي الذي ينظم عمل كافة الهياكل الأكاديمية والإدارية في الجامعة، ويضع الأسس التي تضمن سير العمل بطريقة منظمة وفعّالة. يهدف هذا النظام إلى تحقيق التنسيق والتكامل بين مختلف المكونات الأكاديمية والإدارية، مما يسهم في تحقيق أهداف الجامعة السامية في تقديم تعليم عالي الجودة وبحث علمي مبتكر.

يتضمن النظام الداخلي لجامعة المنارة مجموعة من الفصول التي تشرح هيكلية الجامعة وطريقة إدارة شؤونها، بالإضافة إلى دور ومسؤوليات الأفراد والمجالس المختلفة في تحقيق رؤية الجامعة ورسالتها.

يحتوي النظام الداخلي على الفصول التالية:

• الفصل الأول: التأسيس والأهداف، الذي يوضح المبادئ الأساسية التي تأسست عليها الجامعة وأهدافها الاستراتيجية.
• الفصل الثاني: مجلس الجامعة، الذي يحدد مهام وصلاحيات المجلس الأعلى للجامعة وكيفية اتخاذ القرارات الهامة.
• الفصل الثالث: مجلس الكلية، الذي يعرض هيكلية المجلس داخل كل كلية في الجامعة ودوره في تنظيم العملية الأكاديمية.
• الفصل الرابع: مجلس الأقسام العلمية ورؤساء الأقسام، الذي يحدد آلية عمل الأقسام الأكاديمية داخل الجامعة.
• الفصل الخامس: الهيئة التدريسية، الذي يوضح مسؤوليات أعضاء الهيئة التدريسية وعلاقتهم مع الطلاب والإدارة.
• الفصل السادس: الأمور المالية، الذي ينظم الشؤون المالية في الجامعة ويحدد آلية صرف الميزانية وتنظيم الموارد المالية.
• الفصل السابع: الأحكام الختامية، الذي يحدد القوانين والإجراءات النهائية المتعلقة بالنظام الداخلي وآلية تحديثه.

من خلال هذا النظام الداخلي، تسعى جامعة المنارة إلى تحقيق بيئة أكاديمية متكاملة، تؤمن للطلاب التعليم المثالي، وللكوادر الأكاديمية والإدارية القدرة على أداء مهامهم بكفاءة واحترافية.